1科技投入与投向
从科研活动类型上看，我国2012年基础研究经费比例为4.8%，发达国家这一比例大多在20%左右，相对较低的日本也在10%以上。受我国科技投入基础研究比例偏低影响，水利科技基础研究投入比例也一直停留在低水平，2012年仅为3.3%，低于全国平均水平，也低于农业、林业的水平。
2科研力量布局
在科研力量布局方面，主要介绍国土面积较大、人口也较多的美国和俄罗斯的情况，并与我国进行对比。美国联邦层面的水利科研机构主要包括陆军工程兵团水道试验站、内政部垦务局技术服务中心、内政部地质调查局水资源研究处、国家气象局水文实验室、农业部自然资源保护局水土保持实验室。流域层面没有下属的科研单位，其科研任务主要由大学、相关研究所和企业承担。各州虽说有成立自己水利科研机构的权力，但是大多都设在州立大学中，如爱荷华大学水力学研究所、科罗拉多州立大学水资源研究所、托莱多大学伊利湖水资源研究中心、德克萨斯大学水资源研究中心。美国的水利科研力量布局与水管理体制密切相关，其科研布局以需求为导向进行设置，市场机制在其中发挥了重要作用;水土保持科研机构和地方科研机构多数挂靠在高校，避免了资源的浪费;部分科研机构特色鲜明，如托莱多大学伊利湖水资源研究中心主要研究五大湖———世界上最大的淡水生态系统的水问题;学研结合紧密，人员培养与研究相结合，创新能力较强。俄罗斯联邦层面的水利科研机构主要包括水资源综合利用与保护研究总院、国家水文研究所、土壤改良科学研究院、水工科学研究院股份公司。流域层面没有下属的科研单位。各研究总院基本都在地方设立了分院，如水资源综合利用与保护研究总院设立了8个分院，覆盖了俄罗斯全境，分别负责各地区水利科研工作。俄罗斯的水利科研资源高度集中，有利于攻克重大科学技术问题;按照水资源、水文、水工、水土保持设置研究所，分工明确;基本不存在竞争;缺乏激励机制，难以淘汰低水平研究人员;多学科交叉领域研究能力较弱。我国国家层面的水利科研机构主要包括水科院、南科院、中科院涉水研究所、部分教育部高校。流域层面有长科院、黄科院、珠科院等科研机构。地方层面有26个省、市、自治区设立了省级水利科研机构，部分地方高校也承担一些科研任务。我国的水利科研力量布局与水管理体制和行政区划密切相关。优势是科研机构可直接服务水利行业;科研与流域、区域发展结合紧密;能够吸引人才从事长期研究，并且熟悉流域和地方情况。劣势是存在区域分割，竞争不足;区域的特殊性问题不一定能支撑地方科研机构的生存和发展;流域、区域、地方高校科研平台一定程度上存在重复建设的现象;多学科交叉领域的研究能力不强。
3科技项目管理
在科技项目承担主体方面，发达国家的企业是科技创新的主体，鼓励产学研结合的联合申请，如日本企业与大学、研究机构组成技术创新联盟承担政府部门科研项目。欧盟科技框架计划每个项目申请要求至少3名合作者，并且具有互补性。我国水利行业由于缺乏实力雄厚的高新技术企业，企业在科研中发挥的作用不足，且产学研结合不够紧密。在项目立项评审方面，同行评议是目前比较普遍的评审形式，国外基本都采取了分类立项评估的方式，针对不同项目类型建立了不同的评价原则和评价指标。注重评审专家的独立客观性，确保评审结果公平公正。如欧盟科技框架计划通过招标方式公开遴选评审专家，通过签署一系列合同和协议，避免专家与所评审项目有直接或间接关系，确保专家作为独立人参加评审。在项目组织实施方面，我国科技项目管理“重立项、轻管理”问题比较严重。欧盟科技框架计划和德国会对项目实际进展情况与预期进度的吻合度进行评估，根据评估结果采取相应措施，提出下一步建议，甚至取消项目资助。在科研诚信制度方面，发达国家都出台了一系列政策法规来规范科研不端行为，一些国家还设立了专门的机构处理科研诚信问题。与国外相比，我国水利科技计划实施中失信行为惩处力度不够。如欧盟科技框架计划对于失信行为除了取消未来几年内申请科技项目的资格外，还建立了违约赔偿金和罚款制度。在科研经费管理方面，国外十分重视对科研间接成本和人力资本的合理补偿。美国对间接费用占直接费用的比例没有设置上限，间接成本率为58%左右;人员费用根据项目研究需要申请，如国家科学基金人员费用可以占到总经费比例的80%，在职科研人员约25%的工资可从基金项目经费中支出。我国科研经费对间接费用考虑不足，劳务费和绩效支出比例偏低，不利于提高科研单位和科研人员的积极性。在科技成果评估方面，国外一般采用独立的第三方进行评估，对不同类型科研项目采取分类评估，基础研究注重其创新性，应用研究注重其应用和推广前景。此外，除了对单个项目的评估之外，特别重视对科研机构的整体绩效评估。
4科技转化与推广
在科技推广经费方面，农业科技推广经费每年在7亿元左右、林业每年也有2亿元。水利部科技推广计划专项经费每年只有4500万元，地方设立的推广专项经费每年投入规模在几十万元到几百万元不等，推广经费总规模十分有限。在科技推广服务体系方面，农业、林业设立到县一级的推广机构，农业则覆盖到了乡镇一级。与农业、林业相比较，水利科技推广服务体系十分不健全，部分省(自治区、直辖市)仍未设立相对独立的科技推广机构，特别是基层科技推广机构缺失。在企业发挥作用方面，发达国家的技术开发一般都由企业主导，企业依托高校、科研机构进行技术创新，政府负责推动产业与科技的结合。如美国设立了一系列的产学研合作计划、英国产学研模式多样(教研公司、科学园区、联系计划、法拉第合作伙伴研究中心)。在科技转化服务机构方面，美国、俄罗斯、日本的部分高校或科研机构都建立了自己的科技转移中心，加快技术转化和商业孵化。在扶持政策方面，美国规定联邦政府实验室要把其研究经费的一定比例用于科技成果转化活动。美国、俄罗斯、英国、日本为创新企业提供税收优惠政策。英国还专门为设立了激励科研与产业结合的奖励。
5思考与建议
水利科技体制改革要在国家科技体制改革的框架下进行，此外，事业单位分类来gaige、收入分配制度改革都会对水利科技体制改革产生影响。因此改革要有系统思维，需要统筹推进，要制定完善的配套政策。同时，借鉴国内外经验做法，提出以下粗浅思考和建议。
5.1明确各类创新主体的定位，促进水利科研力量布局不断优化
进一步加大竞争立项的力度，特别是应用研究项目，应打破流域、区域的保护和封闭，要改变“撒胡椒面”式的投入方式，利用市场机制作用，对国家、流域、区域层面科研机构和高校进行优化整合，避免重复建设，形成分工明确、科学合理的科研力量布局。基础性、前沿性和全局性的重大水利科技问题主要由国家层面的`科研单位承担。结合具体需求的水利科技问题主要由流域、区域科研机构和地方高校承担，要放开竞争，促进布局合理化，形成有流域、区域特色的研究机构。部分区域科研机构根据主要业务进行职能转变，更多地承担技术中介、推广等工作。具有明确产品导向和产业化前景的技术开发，企业应作为实施主体。要充分利用高校的学科和人才优势，依托水利部教育部共建水利高校在基础研究和前沿技术领域取得原创新突破，省部共建水利高校可更多地参与到应用基础研究和应用技术研究当中。
5.2完善适应不同类型科研活动特点的投入和管理机制
投入上，加大以政府投入为主的基础研究投入，提高水利原始创新能力;建立政府的财政为主渠道的公益类科研投入机制;产品类项目应以企业投入为主，对于政府引导企业开展的科研项目，可采用“后补助”及间接投入等方式给予支持。立项上，基础研究继续实施政府导向、自由申报、同行评议的管理方式;应用类科技项目实施公开招标，择优选择。评估上，基础研究以同行评价为主，着重评价成果的科学价值;应用研究由用户和专家等相关第三方评价，着重评价目标完成情况、成果转化情况以及技术成果的突破性和带动性;产品类和产业化开发由市场和用户评价，着重评价对产业发展的实质贡献。
5.3完善科研间接费用和人员费用管理
完善科研间接费用和人员费用管理需在中央财政科研项目资金管理改革的基础上进行。实施差异化、精细化的间接费用补偿政策。在成本核算基础上通盘考虑，区分科研承担单位类型，区分科研活动类型，不同单位可根据科研人员实际情况和需求进行部分调整。加强间接费用监管。一方面，健全科技经费监督管理机制，加大对科研经费尤其是间接费用的监管力度。另一方面，项目承担单位可结合自身情况，完善间接费用管理制度，健全内部控制与监督制约机制。重视科研人力资本支出，落实并提高绩效支出比重。适当增加经费使用灵活性，授权高水平创新团队按规定自主支配科研经费，探索顶尖人才自主使用科研经费模式。
5.4建立独立的第三方科技评价机制，加强科研信用管理
注重维护学术研究的独立自主性，在立项、成果评估等环节采用独立的第三方专家团队进行评估，出资人和评估执行者相分离。建立专家数据库，扩充专家库的专家数量和专业范围，实行评审专家轮换、调整机制。实行评审专家回避制度，评审开始前，专家要签署利益冲突声明。制定水利科研信用管理办法，对项目承担单位和科研人员进行信用评价，并按信用评级实行分类管理。建立“黑名单”制度，将严重不良信用记录者记入“黑名单”，阶段性或永久取消其申请财政资助项目或参与项目管理的资格。建立违约赔偿金和罚款制度，加大对失信行为的惩处。根据年度报告、中期检查等节点评估情况决定是否继续进行研究资助，建立项目退出机制。
5.5进一步完善科技转化与推广体系
建立和完善包括水利部、流域机构、省、市、县、乡在内的水利推广机构，鼓励科研单位、技术开发企业设立推广机构。以社会效益为主的技术推广工作，由政府支持的推广机构完成;以经济效益为主的开发类技术，鼓励和支持企业推广。加大资金投入和政策扶持力度，积极争取国家和各级政府的经费投入及信贷、匹配性资金、税收等政策性投入，鼓励、引导全社会多渠道、多层次地增加科技推广投入，加大对重大公益类成果转化与推广的经费投入。创新产学研模式，扶持和培育一批水利高新技术企业，对易于推广的产品设备进行系列化开发及生产，形成一批拳头产品。探索以奖代补，设立激励水利科研与产业结合的奖项。
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