1.3 中西医学与近现代科学理论的比较对中医药现代化的启示 首先，中医学理论与复杂性科学中的系统论、混沌和协同等有着相似性，所以中医学在世界科学界被认同为科学的。但是由于复杂性科学虽然在起初阶段有着极大的发展，而对于认识复杂的大气的流动、骚动的海洋、深邃的大脑，科学家们还是束手无策，虽然做了大量的研究工作，如关于复杂系统的建模问题等，但是没有明确的理论形成，所以就目前来说，期望通过复杂性科学理论来解释和发展中医是困难的，还有待于复杂性科学本身的发展。既然中西医两种医学的认识方法、思维方法及所揭示的现象和规律是不能相互通约的，中西医学不同表述的理论之间是难以沟通的，那么各自的理论体系是不能用来证明对方的。所以用西医理论来解释中医的正确性是牵强的，用西医模式开发中药，如青蒿素、麻黄素等，只能归属于西药的范畴，而用西医的微观指标来解释中医的证候本质、经络本质、复方中药的作用机理，由于其方法上的不统一性，认识事物的方式不同，多个部分的功能总和永远也不可能代替整体的功能，所以这种研究方法也很难有本质上的突破。例如面对证本质研究的现状，许多学者从方法论的高度指出了证本质研究的缺陷［6］。如祝世讷教授［7］以“科学史上的借鉴”为证尖锐地指出，物质现象的本质和物质现象的物质基础不是一回事，物质现象的本质不能归结为某种特异性的实物粒子，事物或现象的物质基础是指决定和呈现为该事物或现象的具体物质形态。”中医学与西医学的理论体系统一，关键是要解决两个理论体系之间的“不重叠问题”，这不可能有两个不完备的理论体系直接“相加”或“合并”来解决［8］。中西医学未来的发展将宣告中西医两种理论并存的局面的终结，但是今天，人们还无法窥见未来的终极真理［9］。
1.4 循证医学思维在中医药领域的运用 以上谈到的方法论主要是从哲学层次即方法论的基本层次对中医药学、西医学和现代科学方法论的阐述。而循证医学研究模式是作为中间层次的对于生命医学这一特定学科的方法学运用，可以说是从临床流行病学派生出来的，这实际仍然算是一种实证推理，只不过他所讲究的实证不再是实验室里某个可测量的指标，而是把在人体上的一种临床实践结果作为证据。它遵循的是临床上的最佳研究证据，再结合临床医生的经验和患者的个人意愿对病人进行科学诊治。它的最核心思想是遵循“最佳”医学研究的“证据”。而对于中医学来讲，目前最可靠的证据主要来自于古代文献和专家经验，那么中医学是要基本遵循于目前所得最佳临床证据，还是要遵循西医的临床流行病学的原则和方法来进行临床试验设计？
卢笑晖等［10］认为，应该对中医学在实践中不计其数的临床验案归纳和提炼，主张从医学典籍、专家经验中去寻找证据，并支持进行设计合理和方式试验可靠的临床试验研究。刘保延等［11］认为，利用信息学、统计学、临床流行病学等方法，对中医临床诊疗实践中大量的诊疗信息加以管理，创建现代个体诊疗体系，是促进中医药现代化非常关键的一步。周训蓉［12］主张全面搜集整理、挖掘古代医家和现代名老中医的宝贵经验和理论，运用“以方统证”或“以证统方”的方法，对所有运用同一方治疗某病的医案及其相关理论进行分析归纳，然后运用数据挖掘技术等现代科学技术，建立某方的系统评价体系，进而揭示方与证之间的对应关系，使中医辨证更科学、更可靠，逐步为国际医学界所公认。窦志芳等［13］认为，中医学在其几千年的发展过程中积累了丰富而实用的临床资料。可以尝试按照“以方统证”或“以证统方”“方证对应”的方法建立适合中医特色的系统评价理论体系。袁宗军［14］认为，将循证医学引入中医药学研究，不可能获得普遍成功。循证医学必须找到一种能客观地评价非线性研究对象的方法［15］，绝不能削足适履。目前，中医药学现代化研究的方法和方向应该是，在“双符合理论”（在宏观上符合中医理论，在微观上符合西医理论）指导下，探索中医药治疗现代医学范畴内疾病的组方规律。刘建平［16］提出，循证医学在推进中医药现代化过程中的具体应用包括：在中医药临床研究中开展国际认可的、高质量的随机对照试验。但需要对RCT进行改良,或者利用大样本的队列研究的特点，同时采用定性研究进行方法学整合，这有可能在中医疗效评价方法学上产生突破。而且非随机的观察性研究方法，包括前瞻性队列研究和回顾性病例对照研究，这类评价方法仍在国际上占据主导地位，这些研究能够作为干预评价的实用方法，同时其结果可为进一步的RCT提供有价值的信息和线索［17］。
2 中医药现代化的发展方向
2.1 建立证候诊断标准进行中医疗效评价 中国循证医学中心总结中医临床医学现代化存在的关键问题和主要难点是：一是缺乏国际认可并能被掌握的诊断最佳证据，二是缺乏国际认可并能推广的疗效最佳证据［18］。中医药现代化两个主要方面及两个关键问题就是证候诊断标准的规范化和中医疗效评价。
证候诊断标准与中医疗效评价这两个方面是密切相关的，但层次分明，有先有后，必须分别进行。证候诊断标准的问题未解决，疗效评价指标中体现中医特色的内容便不能提取出来，所谓中医疗效评价指标和方法的研究也无从谈起。所以说证候诊断标准的研究是中医临床疗效评价指标和方法研究的基本前提，亦即辨证标准搞清楚了，才可顺理成章过渡到中医疗效评价指标和方法的研究［19］。
2.1.1 证候诊断标准的内容 证候诊断标准的规范化需要解决的问题是病证所属症状、体征的规范和疾病所属各证的规范。赖世隆等［20］探讨证候宏观诊断标准的基本框架为：对每一个证候将给出3大部分内容：一是证候规范名称；二是定性与定量相结合的证候宏观诊断标准的要素，包括证候基本临床特征、定性／定位指标、指标重要性排序——权重、证候定量诊断的值；三是证候宏观诊断标准的构建。