(二)第二届全国中外合作办学年会
2011年6月19-21日，以教育部国际司为会议支持机构，厦门大学中外合作办学研究中心联合厦门大学高等教育发展研究中心在厦门大学举办了全国第二届中外合作办学年会。年会以“中外合作办学：规范办学、依法管理、可持续发展”为主题。教育部国际司领导及相关处室负责人一行4人全程参加会议，出席会议的代表来自12个国家和地区，共约250多人。在第二届年会的闭幕式上，厦门大学中外合作办学研究中心提出了成立中国高教学会中外合作办学研究分会的倡议，联合一切有志于中外合作办学科学研究的专家学者和实际工作者，共同推进中外合作办学理论建设。2011年9月2-3日，由本研究中心发起并牵头，湖南大学教育科学研究院，南京师范大学教育科学学院等单位共同发起的中国高教学会中外合作办学研究分会第一次筹备会在厦门大学召开。会后，筹备小组发出了关于成立学会的倡议书、征求意见函和学会章程征求意见稿。广大中外合作办学理论工作者和实际工作者对这个倡议反映热烈，回应踊跃，并提出了许多宝贵意见。目前，学会的筹备工作在教育部国际司和中国高教学会的大力支持和直接领导下，积极稳步推进。
(三)第三届全国中外合作办学年会
2012年11月22-24日，以教育部国际司为会议支持机构，厦门大学中外合作办学研究中心发起并联合海南省教育厅在海南三亚主办了全国中外合作办学第三届年会。会议以“中外合作办学与高水平大学建设”为主题，出席会议的代表来自20多个国家和地区，共360多人。会议开幕前一天，教育部国际司在代表驻地邀请部分代表召开了“学习党的十八大精神，贯彻落实《教育规划纲要》——推进中外合作办学科学发展”专家座谈会，教育部国际司张秀琴司长专程出席并在座谈会上发表重要讲话;中国高教学会会长、中国农业大学党委书记瞿振元，教育部国际司副司长生建学在年会开幕式上发表重要讲话。