人生自古谁无死，留取丹心照汗青经过两个多月的奔波，文天祥终于回到浙江温州。此后，不肯降元的官员们拥立已经降元的南宋恭帝的幼弟为帝，建立了苟延残喘的小朝廷。南宋故土一度只靠文天祥率军独撑残局，终于寡不敌众，于1279年阴历十二月二十日在广东海丰的五坡岭兵败，再次被俘。
元军押着文天祥，走海路经珠江口外的零丁洋，去进攻南宋小朝廷最后的基地崖山(今广东省新会县海域)。文天祥在敌船中写下了《过零丁洋》，千古名句“人生自古谁无死，留取丹心照汗青”即出自此诗。 天地有正气，杂然赋流形1279年阴历十月初一日，文天祥被押送抵达大都，安置在馆驿。元世祖忽必烈很赞赏文天祥的才干，他派已降的南宋恭帝及多批降臣前来劝诱，文天祥不为所动，严词拒绝，后于十月初五日被关进兵马司牢房(在今府学胡同)。
文天祥在关押三年期间，书写了几百篇诗词文章，以抒发爱国之情。1281年夏季，在暑气、腐气、秽气等七气的熏蒸中，文天祥慷慨挥毫，在牢中写就了千古流传、掷地有声的铿锵之作《正气歌》：“天地有正气，杂然赋流形。下则为河岳，上则为日星。于人曰浩然，沛乎塞苍冥……”
唯有一腔忠烈气，碧空常共暮云愁1283年初，元朝侦知有人联络数千人，要起兵反元，营救文天祥。1月8日，元世祖忽必烈亲自提审，作最后的劝降，并许诺授予丞相官职。文天祥告诉忽必烈：“一死之外，无可为者。”
1283年1月9日，文天祥在大都柴市(今北京交道口南大街)被杀害，终年48岁。文天祥在刑场写下了绝笔诗，其最后四句是，“天荒地老英雄丧，国破家亡事业休。唯有一腔忠烈气，碧空常共暮云愁。” 这便是他死前的最后一首诗。
宋代理学发展得很精深，给士人的内心以深切的影响。道德的自觉赋予他们刚正不阿正气凛然的性格。理学家的这种气质常使他们说出一些包罗宇宙的话，如张载说：“为天地立心，为生民立命，为圣人继绝学，为万世开太平。”他们所理解的充满宇宙的气不是自然之气，而是人的高尚的道德精神。这一切也培养了他们成仁取义的宗教情感。文天祥在国家危难之际，始终以这种气节支撑自己履践这种崇高的道德，在临终之时，置生死于度外，从内心扩充这种浩然正气，达到精神上的圆满境界。《正气歌》作为他的述志之作，融汇了他的血肉生命，故说理之中，充满情感，贯充信念，显得气势磅礴。这首诗显示了人类精神的崇高与伟大，体现了人的尊严。激励了后代无数的仁人志士，对铸造中华民族的性格起了很大的作用，是一首不朽的诗篇。