大观年间，张根被任命为转运副使，改为淮南转运使，加任直龙图阁。他又因为水灾多，乞求蠲免租赋，发放洛口米、常平青苗米，赈贷流民。诏令褒扬他。
徙官两浙，谢绝不听，于是写下条疏交驿站传奏。大概说“：现在州郡没有两个月的储积，太仓没有一年的积蓄，军需匮乏，边备不周。东南水旱，盗贼常常发生，西、北二国窥伺日久，怎么能不预先计谋？”于是条列茶盐、常平等利处与弊端，于是说：“从现实考虑，应该节制的大项目，最首要的是土木之功，现在赐给大臣一栋房子，有时耗费百万。我所管辖的二十个州，一年上供才三十万缗而已，甚至不足以供足造一栋住宅的费用。拿住宅来尊宠元勋盛德之臣，犹恐不够，何况赐给那些阿谀邀恩者呢。即使有赵普、韩琦佐命定策之大功，希望陛下也要吝惜赏赐。其次如田园、邸店，虽然不如赏赐宅第那么多，也希望日削月损。像金帛之类，也不可不节制啊。”书表奏上，权贵宠臣很是愤恨，谋求能够中伤他的事件，轮流进上谗言言，皇帝察辨张根的忠诚，没有加罪于他。
不久因为花石纲强行占有漕舟，官府买一根竹子耗费至五十缗，却大多落入诸位大臣之家。于是力陈弊端，更加忤逆权贵，于是摘录张根所书奏牍、注切、草略，认为傲慢不恭，责令他为监信州酒。不久又认为张根诋毁常平之法，摇动继承新法的政策，再贬为濠州团练副使，安置在郴州。不久因讨伐淮贼有功，获准自便居住。以朝散大夫身份死于家中，终年六十岁。