崇祯五年，麟征升为吏科给事中。他上书说：”安民的根本在于守令。郡守廉洁，县令就不敢贪赃。郡守仁慈，县令就不敢酷虐。应该仿照宣宗任用况钟的旧例，认真加以选择，然后以礼派送，再加上用玺书加强他的职权，让他便宜行事，并长久任职。”当时朝廷没能这样实行。八月，暴雨冲毁山陵，昌平发生地震。麟征趁机请求停止派出宦官，上书说：“宦官出使，开始虽然有时能揭发问题，但到最后都变得含糊不清。我请求能撤回网派往各地的使者，来明确宦官不干预政事的道理，采纳大家的意见来选取、贬黜大臣，斟酌办事的情况来权衡官吏，希上天象的变化可以转变，时局的艰难困苦可以补救。”皇帝认为他借事胡乱上奏，严厉地斥责了他。
十七年春，麟征被推举当了太常少卿。不久，贼兵逼近京师，麟征奉命守护西直门。西直门正对着贼兵的要冲，贼兵假扮成勤王部队要求进城。宦官想放他们进来，麟征不同意。他用泥土、石头把西直门塞得坚固无比，然后召募死士，把他们从城墙上吊下去袭击贼兵，斩获了不少贼兵。贼兵攻得更紧了，麟征跑着入朝。到午门时，魏德藻拉着他的手说“：国家像皇天一样有福气，一定不会有什么祸事的。很快军队、粮饷都会聚集起来，您惊慌什么呢？”把他拉了出来。第二天，城被打下了。麟征写信跟家人永别，说“：祖宗打下的二百七十多年的江山，一天之间成了这样，天子自己遭到了灾祸，小百姓也遭殃。我身为一名谏议大臣，对朝廷的事务无法匡救，依法应当剥去袍带解下带子上吊。”家人赶快把他救了过来，围成一圈流着泪请求说：“等祝孝廉来后你们分别一下，行吗？”麟征同意了。祝孝廉名叫祝渊，是跟麟征一起参加乡试考试的人，与麟征交好。第二天，祝渊来了。麟征慷慨地说“：我还记得当年考中进士时咏文信国的《零丁洋》，现在山河破碎了，我不死又能做什么呢？”酌酒跟祝渊告别后，麟征就上吊死了。明朝追赠麟征为兵部右侍郎，谥忠节。 当贼兵打下山西后，蓟辽总督王永吉奏请撤回宁远吴三桂的兵力来守卫关门，希望京城在紧急时有依靠的军队。皇帝把他的意见交下来讨论，麟征认为永吉说得对。辅臣陈演、魏德藻不同意，说“：无缘无故抛弃两百里领土，我们不能承担这个责任。”麟征为这事又写了一篇几百字的奏议，六部官员都不肯署名，只有他一个人上书直言进谏，皇帝帝没有觉悟过来。等到战火完全波及皇宫，皇帝才后悔没听麟征的话。