堀越专心投入到研发飞机的工作中。有一天堀越收到了菜穗子病情加重的电报。他急忙收拾东西流着泪坐火车赶去见到病床上的菜穗子。他拥吻菜穗子，菜穗子怕传染给他，堀越却对她说：“你真美，我爱你。”菜穗子接受了医生的建议，独自一人到高原医院去接受治疗。在医院治疗的菜穗子，突然收到堀越的来信。她偷偷跑出医院，乘车来到了堀越所在的城市。两人在月台上见面，互相拥抱。菜穗子准备见完面就离开，堀越却建议她留下来和自己一起生活。
堀越把菜穗子带到黑川家，请求黑川夫妇为他和菜穗子做证婚人。黑川夫人很感动，黑川却很生气。他认为菜穗子应该为健康着想，回医院治疗。堀越这样做，不是爱情，是自私的表现。堀越却说自己放不下的只有飞机，还有菜穗子。他义无反顾，因为知道自己和菜穗子已经没有多少时间可以浪费了，他不愿意菜穗子一个人在山上治疗。黑川夫妇终于同意了他们的请求。起风了，风中的菜穗子身着嫁衣，那么美，美的似乎有些不真实。
堀越十分珍惜和菜穗子在一起的日子。菜穗子病情已经很严重了，她靠涂抹胭脂来让自己的脸色看起来不那么难看。新的飞机需要试飞，堀越要暂时离开菜穗子几天，两人挥手告别。于是菜穗子独自一人回到医院去治疗病情，她已经没有遗憾了，她把自己最美的一面已经展示给了心爱的人。
飞机试飞成功，广阔的平原上吹起了风。堀越出神的望着远方，似乎意识到了什么。堀越二郎独自一人穿过飞机残骸来到和卡普罗尼首次相见的草原。卡普罗尼似乎早已在那里等他，卡普罗尼问道：“这十年过得怎样？是否过得全力以赴？”堀越回答：“这十年我虽然竭尽全力，到头来却还是支离破碎。” 卡普罗尼告诉堀越，飞机是受到诅咒的美梦，会被天空吞噬得无影无踪。而在梦里，菜穗子却一直都不曾离去。堀越看见，起风了，菜穗子穿着黄衣裙，打着伞迎风走来。菜穗子对他微笑，对他说好好活下去。他答应菜穗子，自己一定会好好活下去。很快，菜穗子随风而逝，宛如一位风一样的佳人。堀越不禁热泪盈眶……
《起风了》里面的梦境越浪漫越斑斓，现实就越伤感。这是一部宫崎骏的收官之作，唯一一部现实主义的影片。故事讲述堀越二郎在年轻时为了梦想不断努力，并在追梦的道路上遇到了一生的挚爱。影片第一场戏就是男主人公小时候的梦境。造飞机与爱情，从表面上看没有直接关系，但其实这两者是一回事。
“造飞机”和“爱情”这两条线索，都围绕着主题“被诅咒的梦想”。两者都被死亡阴影笼罩，而堀越偏偏深爱上“美丽而易逝”的对象，并始终不渝。
还是那句：起风了，唯有努力生存；纵有疾风起，人生不言弃。